近接中国人民银行《关于农村信用社行业管理部门提取总机构管理费的函》（银函［1999］370号），要求解决农村信用社行业管理部门的经费来源问题，经研究，现明确如下：
一、鉴于农村信用社县联社的经费一直未纳入财政预算管理，现实又没有经费来源，其机构改革和职能转换后又具有总机构性质的实际情况，允许向其辖区内的农村信用社提取管理费。提取的管理费的最高比例不得超过农村信用社总收入的2%，具体由各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局商同级农村信用社管理机构确定。
二、农村信用社按税务机关审批标准上交的管理费，在计算企业所得税时准予扣除；超过标准上交的管理费，其超过部分在计算企业所得税时不予扣除。
三、农村信用社县联社提取的管理费支出有结余的，要相应核减下一年度管理费的提取数额。